金元時期道教發(fā)生了顯著的分化，主要表現(xiàn)為新道派的涌現(xiàn)和原有教派的變革。其中最顯著的變化是出現(xiàn)了相繼出現(xiàn)了全真、大道、混元、太一等教派。其中“混元”派是指在北宋，江南道教本以正一教為主干，而在元朝時又與全真教合宗。
在北方，全真、太一和大道三個新教派的出現(xiàn)，不僅豐富了道教的內(nèi)涵，也使得道教在金元時期得到了更為廣泛的發(fā)展和傳播。
在金統(tǒng)治下的北方，這些新的道教派別初起時，都在民間流傳，屬于民間道教。這些新道派的出現(xiàn)，反映了當(dāng)時社會政治環(huán)境的變化，以及道教為了適應(yīng)新環(huán)境而進行的自我調(diào)整。
“全真教”是金朝統(tǒng)治北方的產(chǎn)物，主要由北方一些大地主所提倡和組成。全真教的出現(xiàn)雖然最晚，但其影響勢力卻是最大的，對道教從理論到活動方式都產(chǎn)生了重大影響，因此被稱為道教史上的“鼎革”?！疤唤獭薄按蟮澜獭币彩墙鸪蠼膛芍唬瑒?chuàng)立于金朝初年，注重儒家倫理道德，所有掌教都要改姓蕭姓。太一教在金朝上京地區(qū)有所傳布，其特色在于崇重符箓，用于給民眾治病、驅(qū)邪、避災(zāi)等。大道教的特色和具體實踐方式在雖然在資料中難以查明，但作為當(dāng)時道教的重要組成部分，對道教的發(fā)展和傳播起到了重要作用。
這些新教派的出現(xiàn)，不僅促進了道教在金元時期的興盛，也使得道教在理論和實踐上都有了新的發(fā)展和創(chuàng)新。全真、太一和大道教的共同發(fā)展，為道教在金元時期的廣泛傳播和深遠(yuǎn)影響奠定了基礎(chǔ)。
金元時期，道教在南方也經(jīng)歷了宗派紛起的局面，形成了新的教派格局。南方以符箓?cè)剑ㄖ柑颇┧纬?，道教中的天師道和上清、靈寶派分別以龍虎山、茅山、閣皂山為活動中心）為主，包括“神霄”“清微”“凈明”等派別，其中最為顯著的是“金丹派南宗”的崛起。金丹派南宗的特色在于其以內(nèi)丹修煉為核心，主要活動地域在江南，因與北方的全真道相對，故稱“南宗”。該道派的祖述源于五代至北宋時期的道士鍾離權(quán)和呂洞賓，張伯端被視為開派祖師。張伯端之后，石泰、薛道光、陳楠、白玉蟾等人承傳道法，形成了金丹派南宗的傳承體系。白玉蟾在南宋時期組織了一個較為嚴(yán)整的道派，使得金丹派南宗得以正式確立。在組織與思想建設(shè)方面，白玉蟾的活動頗受道門稱頌，其活動范圍主要在江南地區(qū)，尤其是武夷山，其教義和修行方法對南方道教的發(fā)展產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。
在金朝和元朝的統(tǒng)治下，道教除了教派出現(xiàn)了分化，內(nèi)部也出現(xiàn)了新的變化。原有教派的變革主要表現(xiàn)為儒釋道三教合一思想的出現(xiàn)及以修持內(nèi)丹術(shù)為主的金丹道派開始興起。
三教合一是指儒教、釋教（佛教）、道教三個教派的融合。對于此種現(xiàn)象，學(xué)者多以“三教合一統(tǒng)”而論之。然而，從三教并立到三教合一，必定有一個改革過程。到元、明期間“三教合一”一詞的三教間關(guān)系已經(jīng)具有內(nèi)質(zhì)的演變。
而金元時期三教合一思想的出現(xiàn)主要還只體現(xiàn)在全真教的實踐和教義中。
全真教在金元時期其教義和實踐中“三教合一”思想主要體現(xiàn)在以下幾個方面：
在實踐上，全真教在教義上融合了儒、釋、道三家的思想，更強調(diào)“三教”的共同點。認(rèn)為三教雖然各有其特色，但最終都指向同一真理。這種思想在全真教的經(jīng)典和詩文中得到了充分的體現(xiàn)。
其二是出世思想實踐。全真教強調(diào)出世思想，認(rèn)為人生是“苦?！?，家庭是“牢獄”，夫妻恩愛為“金枷玉鎖”，鼓勵人們看破功名富貴，學(xué)道煉丹，以離“苦海”。
其三是成仙信仰和修煉理論。全真教倡導(dǎo)“陽神”“真性”不死，認(rèn)為人的肉體是會死的，但人的精神可以不死。在內(nèi)丹修煉上，主張先性后命，以性兼命，強調(diào)澄心遣欲為真功，明心見性為首務(wù)。
持修內(nèi)丹即“內(nèi)丹術(shù)”。這種丹術(shù)是仙家一種重要的修煉方法。簡言之，是以“天人合一”思想為指導(dǎo)，以人體為“丹爐”；以體內(nèi)的精、氣、神為“藥物”，通過“煉己筑基、煉精化氣、煉氣化神、煉神還虛、煉虛合道”等步驟，而在體內(nèi)凝煉結(jié)丹，以達(dá)成強身健體、延年益壽、甚至長生成仙的目的。
“金丹道派”原指秦漢以后重外丹“黃白術(shù)”的道派。黃白術(shù)即“煉金術(shù)”亦稱“外丹術(shù)”，是以人工制造的藥金和藥銀為原料，以煉制聲稱服后不死而成仙的丹藥為主，二者合稱“金丹術(shù)”。精于金丹術(shù)的道士組成了“金丹派”。唐末五代時內(nèi)丹學(xué)興起，而后外丹派和內(nèi)丹派結(jié)合，稱黃白術(shù)為“地元丹法”內(nèi)丹術(shù)稱為“人元丹法”，煉丹術(shù)則稱為“天元丹法”。宋元以來丹派和道派合一，金丹派道教成為和經(jīng)箓派道教分立的大道派。后世習(xí)出煉金丹術(shù)的道士尊崇八仙之一的曹國舅，所創(chuàng)立的道派名金丹派。
南宋和金的對立，讓道教分為南北兩個區(qū)域，此間涌現(xiàn)出了許多新的教派。但隨著元朝的一統(tǒng)，各大道教派別逐漸融合起來，形成了天下道教南北融合成為正一和全真兩大教派兩大教派的局面。
綜上所述，金元時期道教的發(fā)展經(jīng)歷了從新道派的涌現(xiàn)到原有教派的變革，以及在元朝統(tǒng)一后各大教派的融合，這一時期的道教發(fā)展呈現(xiàn)出多元化和統(tǒng)一化的雙重特征。
