在中共山東省委和泰西特委的領導及各縣委的支持下，新建成的八路軍山東縱隊第六支隊全體指戰(zhàn)員，不負泰西人民的眾望，以昂揚的斗志和必勝的信心，投入新的更加激烈、殘酷的斗爭。
這次自衛(wèi)團的改編，是泰西地區(qū)我黨領導下的游擊隊歷史性的跨越，不僅使這支地方武裝力量納入八路軍山東縱隊的戰(zhàn)斗序列，更重要的是標志著這支武裝開始由一支地方游擊隊向更加正規(guī)和領導有力的主力部隊轉變。同時，也泰西地區(qū)抗日武裝力量建立和發(fā)展有了更堅實的基礎，泰西地區(qū)的抗日斗爭也進入了嶄新的階段。如何使這支泰西地區(qū)發(fā)展起來的武裝力量，在黨的領導下盡快成長為一支有組織、有紀律、有戰(zhàn)斗力的部隊，日益成為一項迫在眉睫的工作。
此時的泰西地區(qū)的抗日武裝力量雖已編入山東縱隊戰(zhàn)斗序列，但部隊成員的主要成份，卻依然是以我黨在泰西武裝起義時組織的游擊隊為主，省委及中央派遣來部隊的紅軍骨干、黨員及進步教師和學生占有比例極低，大部分是本鄉(xiāng)本土的農民以及改編的地方保安隊等。由這些成員組成的游擊隊，在日軍入侵、國土淪亡之際，揭竿而起，保衛(wèi)家鄉(xiāng)，抗擊敵人侵，表現(xiàn)出極高的抗日熱情和不屈不撓的斗爭勇氣。但在斗爭中，也暴露出了部隊組織紀律性不強、戰(zhàn)斗力不強等方面的問題。這些問題，亟待解決。
1939年初，山東縱隊成立不久，即提出了對所屬部隊進行全面整頓的要求，并制訂了第一期整軍計劃。3月初，八路軍一一五師直屬機關及六八六團大部以東進支隊名義挺進山東，抵達泰西。3月14日，東進支隊在東平常莊與泰西地委、六支隊會合。師部與直屬隊伍駐常莊、徐坦一帶，泰西地委機關隨師部一起活動，六支隊駐東平馬莊，六八六團駐肥城城南尚任一帶。根據(jù)師部命令，原華北冀魯邊七團開抵泰西，進行整訓。魯西區(qū)黨委機關與津浦支隊經(jīng)由大峰山區(qū)趕赴常莊與一一五師會合。
一時間，肥城南部及東平北部山區(qū)集中了﹣﹣五師機關及部隊，魯西區(qū)黨委、泰西地委及六支隊，津浦支隊、冀魯邊七團等機關、部隊。
為盡快打開泰西地區(qū)抗日斗爭新局面，羅榮桓建議由魯西區(qū)黨委機關和泰西地委組織一次黨的會議，以便迅速向泰西地區(qū)黨的組織和部隊傳達中共中央擴大的六屆六中全會精神。3月20日，泰西地委在東平四區(qū)常莊召開了"泰西地區(qū)抗日活動積極分子大會"。部隊及地方黨委負責人參加了會議，六支隊營以上干部也參加了會議。羅榮桓向大會傳達了中央擴大的六屆六中全會精神和毛澤東同志的政治報告《論新階段》。羅榮桓詳細分析了抗日戰(zhàn)爭進入相持階段后將會出現(xiàn)的新的斗爭形勢，指出：要根據(jù)中央鞏固華北，發(fā)展華中的戰(zhàn)略方針，及時調整戰(zhàn)略部署，以適應抗戰(zhàn)新局面的到來。他說："一一五師挺進山東，是執(zhí)行中央的戰(zhàn)略決策，開展敵后游擊戰(zhàn)爭，建立穩(wěn)固的山東抗日根據(jù)地。并明確提出要加強泰西抗日根據(jù)地建設，依托泰肥山區(qū)、大峰山區(qū)、平阿山區(qū)和東平湖，向四周發(fā)展，使之與山東各根據(jù)地連成一片"。為此，一一五師幫助地方黨委、武裝部隊開展了建黨、建政、整軍等工作。
根據(jù)會議部署，一一五師與魯西區(qū)黨委、泰西地委、六支隊研究決定，由一一五師司令部、教導大隊，協(xié)助六支隊進行整訓，以全面快速提高部隊政治、軍事素質，增強部隊戰(zhàn)斗力，為積極開展武裝斗爭做好軍事上的準備。
自4月份開始，一一五師司令部、政治部、供給部、教導處多次舉辦各種類型的學習班，為六支隊及各縣地方武裝培訓了大批軍事指揮員、政治指導員、后勤供給員、鋤奸特派員等。在這次整訓中，六支隊對部隊建制進行了調整，各團取消政治處、參謀處、供給處及營一級設置，由團直接指揮連，將營職指揮員充實到連隊，并對部隊成員進行了調整，抽調一部分干部到地方從事建設政權工作。原六支隊司令員劉海濤調離，由張北華任司令員。為加強六支隊的骨干力量，一一五師選派一部分有經(jīng)驗的營連干部到六支隊任職，在戰(zhàn)斗中幫助六支隊基層指揮員提高作戰(zhàn)指揮能力。同時，加強部隊基層連隊黨支部建設，吸收一批骨干加入黨的組織，不斷增強部隊黨員隊伍的力量。大力開展紅軍光榮傳統(tǒng)教育，提高部隊干部戰(zhàn)士的思想覺悟。經(jīng)過短期整訓后的六支隊，軍政素質有顯著提高，進一步增強了部隊戰(zhàn)斗力。
6月，根據(jù)集總整軍計劃，山東縱隊開始第一期整軍，六支隊在一一五師幫助下，進行第二次整編。司令員張北華調離，由何光宇任司令員，石新安任政委，團改營建制，一、二、三團改為一、二、三營（10月，三營改特務營，高塔拉任營長，張心田任教導員。冬，長清縣獨立營升級編為三營），泰安（西）獨立團改為獨立營；成立泰西地區(qū)自衛(wèi)隊司令部，肩負站崗放哨、捉漢奸、送情報、教育監(jiān)視偽頑家屬、保衛(wèi)地方政權和群眾利益、協(xié)助部隊作戰(zhàn)等任務，各縣均成立了自衛(wèi)隊司令部；改編東汶寧支隊，由東平縣游擊大隊長陳本清任司令，六支隊一營營長劉繼星任副司令。為加強黨對該支隊的領導，-﹣五師派劉漢任政委，六支隊派王少云任政治處主任。原六支隊一營編為東汶反叛被處決，其二、三營被繳械）。寧支隊一營，胡國軍任營長，解抑峰任教導員；陳本清部編為二、三營（后陳本清意欲反叛被處決，其二、三被繳械）。
在一一五師幫助下，經(jīng)兩次整編，六支隊增強了組織紀律性，克服了游擊習氣，戰(zhàn)斗力進一步增強。六支隊同一﹣五師一起活動，聯(lián)營駐防，同開軍民聯(lián)歡會，一起唱歌，浩浩蕩蕩，朝氣蓬勃。
自從﹣﹣五師進入泰西以來，整個泰西地區(qū)對敵斗爭形勢發(fā)生了顯著變化，敵我雙方力量對比隨之改變。一﹣五師、津浦支隊、冀魯邊七團以及六支隊等作戰(zhàn)部隊均駐防于泰肥山區(qū)、東平一帶，使我軍局部力量處于絕對優(yōu)勢。在此期間，六支隊配合主力部隊，積極開展武裝斗爭，多次沉重打擊日偽軍。
3月16日，東汶支隊（六八六團兩個連及六支隊一團組成）一舉拔掉東平圍里據(jù)點，斃俘偽軍100余人，繳槍60余支。22日，又于鄭海村擊潰日軍一部300余人。戰(zhàn)斗中，六支隊一團團長陳伯衡犧牲。
泰西軍事斗爭形勢的發(fā)展變化，引起了敵人的極大恐慌。自5月初起，日軍糾集山東主力作戰(zhàn)部隊及地方守備部隊5000余人，對我泰肥山區(qū)黨政機關及部隊發(fā)起合圍。5月11日上午9時，一一五師師部、魯西區(qū)黨委、津浦支隊，以及泰西地委、六支隊一部、六八六團等機關部隊近3000人被敵人包圍在肥城陸房一帶。被圍部隊依托山地構筑工事，沉著應戰(zhàn)，多次擊退敵人進攻。戰(zhàn)斗一直持續(xù)到黃昏。經(jīng)過一天激戰(zhàn)，我軍指戰(zhàn)員殲敵1300余人，并于晚間突出重圍，順利抵達東平無鹽村。
陸房一戰(zhàn)表明，我軍還缺乏在平原地帶開展游擊戰(zhàn)的經(jīng)驗。同時，由于泰肥山區(qū)狹小，大規(guī)模部隊無法展開并實施機動作戰(zhàn)。一﹣五師首長根據(jù)中央軍委指示，決定師部機關、直屬隊大部向鐵路東轉移。師司令部組成輕便指揮機關，與六八六團轉移至東平湖一帶活動，六支隊仍然堅持泰西地區(qū)武裝斗爭。
根據(jù)﹣﹣五師指揮部決定，六支隊將部隊化整為零，分別活動于大峰山區(qū)、泰肥山區(qū)和東（平）汶（上）寧（陽）平原地帶。8月，六支隊按照魯西區(qū)黨委會議部署，充分依靠群眾，在肥城、寧陽、汶上等地開展了挖溝、破路、破圍寨的"改造地形，創(chuàng)造戰(zhàn)場"斗爭，為開展平原游擊戰(zhàn)爭創(chuàng)造對我軍有利的游擊環(huán)境。
8月，為加強對地方武裝的領導，魯西軍政委員會決定，-﹣五師獨立旅兼魯西軍區(qū)，六支隊在東平縣榮花樹村召開首屆部隊黨代表大會，總結建黨、建軍經(jīng)驗，提出新的工作任務。繼而六支隊將各縣武集合于肥城境內進行整訓，充實調整縣獨立營負責人，加強軍政訓練，使各縣武裝提高了軍政素質。
9月，八路軍一一五師根據(jù)集總命令，在陳光、羅榮桓率領下，開始向魯南轉移。同時，八路軍東進縱隊在肖華司令員帶領下，由冀魯邊分批進駐運（河）東、泰西結合部活動。9月15日，為掩護駐東平二區(qū)一帶休整的﹣﹣五師師部，六支隊二營成功阻擊了從東平、平陰進犯之敵800余人，打退敵人七次進攻，斃敵近百人，掩護一一五師部隊安全轉移。主力部隊撤離后，泰西敵我斗爭的形勢隨之發(fā)生變化，國民黨肥城縣長田家濱公然與泰西地委、六支隊對抗，制造磨擦，并糾集肥城、東平地方武裝，襲擊抗日政權，綁架抗屬，毆打群眾，蓄意挑起事端，破壞抗戰(zhàn)統(tǒng)一陣線。10月，泰西地委根據(jù)中共中央《關于山東工作方針》中"對頑固分子無理舉動，以態(tài)度強硬為原則"的精神，指示肥城縣委對田家濱展開堅決斗爭。
六支隊根據(jù)地委決定，派出三營協(xié)助肥城、長清地方武裝，會同當?shù)厝f余群眾，將田家濱部驅趕出泰西地區(qū)。進入11月后，日偽軍糾集寧陽、汶上、東平、東阿、肥城等地千余之敵，開始對泰肥、平阿山區(qū)我黨政軍機關、部隊駐地突襲。六支隊各部隊與各地武裝密切配合，與敵激戰(zhàn)一周，成功擊退各路進攻之敵，斃傷敵200余人，繳獲步槍70余支，粉碎了敵人的"掃蕩"。面對主力部隊轉移后出現(xiàn)的新的斗爭局，六支隊根據(jù)首屆黨代會提出的任務，及各縣地方武裝兵員不足，戰(zhàn)斗力不強，急待整頓提高的問題，決定進行整頓。
1940年初，泰安（西）獨立團與駐夏張?zhí)┓湿毩I大部奉命合并改編成泰安（西）獨立營，栗森任營長，吳濤任政委。2月初，一、二連升級補充一一五師教三旅九團，后又將地方區(qū)中隊、回民大隊等抽調補充獨立營，為泰西獨立一營；肥城獨立營重新組建后，由王正南任營長，李文甫兼任政委，為泰西獨立二營；長清獨立營為泰西獨立三營，王月亭任營長，張有壬任教導員；1939年5月，平阿基于大隊已有隊員300余人，先后發(fā)展組建兩個獨立營，一個營隸屬六支隊，后升級主力，后又組建泰西獨立四營，馬亞魯任營長兼教導員；10月，按照上級命令，東平縣基于大隊改稱東平獨立營，展慶鯤任營長，劉仲羽兼政委。1940年2月改編為泰西獨立五營，王課亭任營長，強仁普任政委；寧陽獨立營改編為泰西獨立六營，朱景璜任營長。汶（上）東縣尚無基干大隊，后成立汶（上）東游擊大隊，由縣長張云峰兼任大隊長。
